² NCBI(National Center for Biotechnology Information),http://www.ncbi.nlm.nih.gov,美国
美国国立生物技术信息中心创建的关于分子生物学,生物化学,和遗传学知识的存储和分析的综合系统。NCBI数据库包括Nucleotide(核酸序列数据库)、Genome(基因组数据库)、Structures(分子模型、结构数据库)、Taxonomy(生物学门类数据库,可以检索或浏览其核苷酸序列、蛋白质序列、结构等)、PopSet(种群进化关系分析数据库)等。NCBI数据库检索包括OMIM(人类基因和基因疾病检索)。BLAST(Basic Local Alignment Search Tool,序列相似性检索)等。
² DDBJ(DNA Data Bank of Japan),https://www.ddbj.nig.ac.jp,日本
由日本国立遗传学研究院负责数据库的建设,维护及数据的传播,并与NCBI和EMBL合作;可以从世界各地通过网络把序列直接提交该数据库。DDBJ网页上也提供了包括FastA和BLAST在内的数据库查询工具。
² EMBL(European Molecular Biology Laboratory),https://www.embl.org,欧洲
欧洲生物信息学研究所创建的一个核酸序列数据库。可以利用序列查询系统SRS(Sequence Retrieval System)从EMBL数据库中提取有关信息。SRS序列查询系统通过超文本链接将DNA序列数据库和蛋白质序列、功能位点、结构、基因图谱以及文献摘要MEDLINE等各种数据库联系在一起。利用提供的BLAST或FastA程序,可以对EMBL数据库进行未知序列同源性搜索。
² 国家基因库,https://www.cngb.org,中国
我国首个获批筹建的国家级基因库,以对海量生物资源的存、读、写能力为基础,搭建起基因资源挖掘的公益性、开放性、支撑性、引领性的服务平台,是引领我国生命科学和生物经济发展的战略性科技力量。